检察院在审查起诉阶段，如果发现主要犯罪事实不清、证据不⾜、遗漏罪⾏或者遗漏同案⼈的，可以退回公安机关补充侦查。这个时候，检察院要撰写《退回补充侦查决定书》，写明退查的理由和需要补充查明的具体事项及要求。
对于补充侦查的案件，公安机关应当在1个⽉以内补充侦查完毕。如果主要事实或证据上发⽣了重⼤变化，就需要重新制作起诉意见书；如果只是在个别情节补充了材料，可以用书⾯意见的形式移送检察院;如果公安机关撤销案件的，也需要将决定通知检察院。
案件退回补充侦查，一退一进估计要两个月时间，退两次，就要延长4个月左右。为了防⽌拖延时间，避免对嫌疑⼈超期羁押、久押不决，法律规定补充侦查不得超过两次。
